Ciao.
Allora un sito joomla è composto da una serie di file e cartelle e da un database.
In linea generale tutti i contenuti del sito vengono inseriti nel database. Quindi facendo il backup del database salvi almeno l'80-90% dei contenuti del sito. Fanno eccezioni le galerrie di immagini e i gestori di documenti come docman che salvano immagini e files nelle loro directory.
Per cui io ti consiglio di fare un backu generale del sito cme da guida che ti ho inviato nel precedente post.
Dopodichè joomla si disinstalla semplicemente cancellando i files e le cartelle dallo spazio web in cui si trovano. Niente di più semplice