quella non è una sottodirectory ma una semplice cartella...
una sottodir è scritta così:
sottodir.nomesito.com
e si scrive nella barra senza il www.
ha propri dns e una propria root
dico questo perchè nel caso tu abbia comprato la disponibilità di una sottodir allora non sono stati onesti..
comunque no, non puoi eliminare quel nome (che comunque potresti cambiare come ti pare) senza altri accorgimenti anche da comprare come ad esempio un redirect