Ciao e benvenuto nel forum.
La soluzione più semplice ed indolore è quella di fare più installazioni di joomla.
Una installazione principale nella root dello spazio web ed N installazioni in sottocartelle per quanti sono i comitati.
In alternativa alle installazioni in sottocartelle potresti optare per dei sottodomini del tipo sito.it il proncipale e poi comitato1.sito.it; comitato2.sito.it e così via.
Questa è la soluzione più semplice, veloce ed indolore. Certo bisogna optare per un servizio di hosting adeguato ovviamente.