Finalmente ho risolto..

ho eliminato dalla root principale del sito il file index.html, quindi mi sono ricavato il percorso assoluto scrivendo con il blocco note al suo interno il seguente codice:
<?php
$p = getcwd();
echo $p;
?>
l'ho salvato e l'ho chiamato path.php poi l'ho caricato tramite ftp nella cartella public_html
quindi ho digitato:
www.nome del sito.it/path.php
ottenendo cosi il percorso assoluto.
Poi ho modificato il file configuration.php trascrivendo il percorso assoluto nelle varianti:
var $log_path = 'percorsoassoluto/logs';
var $tmp_path = 'percorsoassoluto/tmp';
togliendo logs e tmp.
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