Potresti anche ignorarli perchè non sono pagine reali che producono errori ma dei link che il motore, ovviamente, non riesce a seguire.
In ogni caso, credo che questi errori presto scompariranno dal tuo tool.
Non so se possa funzionare, ma ti converrebbe provare a fare un redirect di tutte le pagine con # verso la home. Ma non è funzionale come metodo. Gli utenti non capiranno.