ti conviene bere una camomilla e rifare tutto senza fare casino.
Sicuramente hai mischiato locale remoto e secondo me con l'ftp hai caricato anche qualche penna che avevi sulla scrivania
Se usi l'ftp sei soggetta a rallentamenti del server e magari files che si mettono in pausa un'attimo o la connessione che cade.
Tranquilla, riconnetti e riprende da solo.
Guarda i files caricati e quelli da caricare, dovrebbe esserci una finestrella
Una volta che funziona o in locale o in remoto, comincia a duplicarlo, almeno riparti da una cosa funzionante.
Se funziona, dimenticati tutto ciò che non sta in templates, non continuare a caricare e scaricare le cartelle.
Cerca di dare i permessi giusti a tutte le cartelle, molti guai sono causati da quello.
Molti hoster lo fanno in automatico quando installi, però da ftp no, ti lasciano i permessi che ha il file in locale, e non è detto che il tuo server dia i permessi corretti.
Quando inizi con le modifiche, falle 1 per volta e prova... và? ...bene... non va,? torni indietro...
finchè il problema è uno si riesce a risolvere, se inizi a sommarli diventa un casino.
calma....
M.