per questo cercavo un qualcosa che accettasse buona parte dei filmati per poi comprimere tutto in flv.. come accade su youtube o su facebook praticamente...
se il tuo server te lo lascia usare puoi installare delle estensioni ffmpeg ma usano istruzioni interne al server quindi generalmente disattivate per motivi di sicurezza..
di solito si acquistano servizi hosting dedicati a tale lavoro, con sistema operativo a 64bit, processori almeno quadcore e ram infinita con banda generosissima ecc...
si fa ma costa, se hai un ottimo budget ti è sufficiente fare una ricerca in rete perchè qui non si fanno riferimenti commerciali..