Dipende come vuoi strutturare i due o più siti.
Lo puoi fare, perchè basta assegnare ad esempio ai diversi siti delle diverse sezioni, utilizzando poi le categorie per suddividere gli argomenti.
Inoltre puoi facilmente assegnare una veste grafica differente alle diverse sezioni. Poi con un redirect fai puntare i vari domini alle differenti sezioni.
Certo, ci sono dei limiti, ma con un po' di fantasia ci si riesce.
Ciao