Allora:
Informazioni sistema: versione php 5.4.10 contro 5.4.45
impostazioni php: open basedir: un sacco di cose contro nessuno / display error: no contro si / funzioni disabilitate: nessuno contro system,popen,dl,passthru,proc_open,shell_exec / permessi cartella:configuration scrivibile contro non scrivibile
Provo a cambiare i permessi del secondo e rilancio l'aggiornamento.