Ho controllato il codice sorgente (conriferimento al css).paragonandolo al codice sorgente di un sito che ho sul mio pc ( il quale lavora bene con o senza friendly url ) e sono simile... niente di strano.....
<link rel="stylesheet" href="
http://www.miosito.com/templates/system/css/system.css" type="text/css" />
<link rel="stylesheet" href="
http://www.miosito.com/templates/system/css/general.css" type="text/css" />
<link rel="stylesheet" href="
http://www.miosito.com/templates/ja_purity/css/template.css" type="text/css" />
Ho per caso controllato la parte sbagliata?

**Io uso lo stesso hosting di tutti i siti ufficiali di joomla, quindi predisposto a questo CMS**