Non ho ancora provato nulla per non "sporcare" il trasferimento, ho letto che se alcune cose non sono configurate bene, soprattutto con le installazioni ex-novo (non è il mio caso), Joomla! potrebbe lavorare male e restituire errori.
Di solito si danno determinati permessi per le cartelle di cache o di upload, con Joomla! quali sono le cartelle interessate? Oppure mi vuoi dire che non serve fare nulla?