il discorso è questo:
Joomla è sviluppato con linguaggio php e adatto a server apache e db Mysql, non è che su win non funziona, nessuno lo ha mai detto, solo che si verificano problemi di cui Joomla non intende occuparsi.
Probabilmente con un po di hardening riesci anche a farlo funzionare, ma preparati ogni volta a risolvere problemi.
Sul forum è difficile darti una mano poichè non esiste una sezione o chi si occupi dei problemi di J su iis, preferiscono tutti o quasi evitarli seguendo i consigli degli sviluppatori.
M.