Non sono un esperto però . . .
il mio consiglio è di disabilitare l'FTP Layer ed utilizzare Filezilla per trasferire i files sul server via FTP.
Il backend di Joomla utilizza uno script php lanciato dall'utente apache quindi per poter installare qualcosa dal backend c'è bisogno che l'utente apache possa scrivere nelle cartelle necessarie.
Se questo è il problema allora potresti provare a dare i permessi 777 alle cartelle modules/plugins/language/templates, administartor/modules, administrator/plugins . . . sempre con Filezilla.
ciao