IE penalizza severamente gli errori di scrittura del codice del template, mentre gli altri browser sono più tolleranti.
in particolare IE penalizza i div annidati, quindi si tratta di riprendere i .css del template in uso e con pazienza rivedere le div soprattutto quelle, che poi contengono un po tutta la storia del sito tra errori commessi dallo sviluppatore e poi correzioni su correzioni e poi modifiche su modifiche..
ad un certo punto occorre rivedere il tutto, IE è un ottimo banco di prova.