Se hai un dominio con joomla installato, utilizza sempre joomla per il blog.
ma il discorso indicizzazione è uno step successivo!
il discorso è sempre a monte... bisogna PIANIFICARE e capire quali sono le esigenze.
Può avere senso usare su uno stesso hosting joomla e wordpress magari con una struttura del tipo miosito.it e blog.miosito.it magari con wordpress.
E' chiaro che wordpress è il CMS piu adatto a gestire blog ma questo non vuol dire che joomla non sia all'altezza, anzi...
io credo che joomla sia uno dei pochi CMS che ti permetta di realizzare davvero tutto quello che vuoi, wordpress invece è troppo orientato ad una struttura blog e questo rende difficile utilizzarlo per strutture piu amplie.
è solo un mio parere