..
se il vecchio sito non ti serve più...puoi tranquillamente cancellare tutto
e partire da zero con l'installazione di joomla
..se invece vuoi far continuare a visualizzare il vecchio sito
nel frattempo che crei il nuovo con joomla..puoi creare una sottocartella nella root
e procedere ad installare joomla in questa sottocartella(la procedura non cambia)
..quando il sito joomla sara' pronto
cancelli il vecchio e sposti i file dalla sottocartella alla root
aggiornando nel file configuration.php i percorsi (path)
ciao