Aspetta, devi stare calmo che si risolve tutto.
Quando hai fatto il backup con Akeeba, questo ti ha creato un file con l'estensione JPA che si trova nel percorso di cui ti dicevo prima, questo file (è una specie di archivio particolare) contiene TUTTO il tuo sito (database compresso).
Per ripristinare, oltre questo file ti serve anche il file akeeba kickstart. Ulteriormente devi seguire la guida per rifare la copia del tuo sito in locale.
Una volta fatto questo non ti resta che caricarlo in remoto sostituendo quello esistente che è danneggiato.
Spero che mi so spiegato bene...