A me è successa la stessa cosa e avevo subito un attacco, diverse index.php si erano... sbiancate (non è detto sia il tuo caso)
Potresti provare a cambiare template (Se è il primo purity ho letto da qualche parte che ha qualcosa che non va)
Potresti provare a disabilitare le opzioni SEO per vedere se dipende da quello
Sono indicazioni un po'... random ma almeno puoi iniziare a eliminare qualche ipotesi.
ciao