se hai modificato il template ... a seconda del livello delle modifiche puoi tenerlo e aggiungere il tuo nome oppure levarlo. Per il template non mi pare di aver letto questioni fondamentali, in giro.
Per il footer, certo, puoi levarlo, ma magari se lo modifichi e lasci un piccolo riferimento a joomla, che male c'è?
Comunque ... certo, li puoi fare quello che ritieni più opportuno fare
