joomla .12 ti avverte che configuration è scrivibile solo perché puoi settare a 444.
Non significa che la directory che ti da il problema lo sia in modo corretto.
Prova ad attribuire per qualche minuto a quella cartella i permessi a 777 (se il server non lo supporta, prova 775) e ritenta il caricamento.
Se dovesse funzionare, il problema sta nei permessi.