puoi eliminare tutto, quelli sono file temporanei che si eliminerebbero da soli con i tempi prestabiliti nelle impostazioni generali.
una volta è successo che il sito non funzionasse più, ma era dovute ad altre maldreste operazioni compiute precedenti alla cacellazione, quindi non mi prendo nessuna responsabilità
è dovere del gestore del sito avere sempre un backup funzionante di file e database.