Cerchiamo di fare un po di chiarezza che mi sa che ci perdiamo in un bicchiere d'acqua
a) hai un file.zip all'interno del quale ci sono tutti i file del tuo template
b) dal backend del sito vai in estensioni-->installa/disinstalla e carichi il tuo file.zip (usando carica file da pacchetto e poi sfoglia: si apre un browser che ti chiederà dove prendere il file.zip). scelto il file usa il pulsante "carica file & installa"
c) A questo punto sopra il file caricato comparirà un messaggio che dice "Installazione template: eseguita correttamente".
d) vai in gestione template metti la spunta al template caricato e lo metti come predefinito.
N.B. A parte il punto d) che è proprio della gestione dei template in joomla, i passi precedenti sono quelli che ti permettono di caricare qualsiasi tipo di estensione sia essa componente, modulo o plugin (bot)
Sappimi dire come è andata