Non saprei spiegartelo con parole migliori di quelle scritte in quella guida. Il codice per inserire una nuova posizione modulo è questo:
<?php /*Aggiungo la nuova posizione modulo */?>
<?php if ($this->countModules('nomeposizionecreata')) : ?>
<div id="nuovo_div">
<jdoc:include type="modules" name="nomeposizionecreata" style="xhtml" />
</div>
<?php endif; ?>
<?php /*Fine aggiunta nuova posizione modulo*/?>
e lo devi incollare nel tuo caso SOTTO a questo:
<jdoc:include type="component" />
che è assolutamente impossibile che tu non abbia nella tua index.php
Dopo pubblicherai il modulo con la IFRAME, immagino un banner pubblicitario, in quella posizione che hai creato.
Non puoi fallire