Devi editare il file components/com_content/helpers/icon.php, funzione pdf(), e riscrivi questa linea :
$attribs['onclick'] = "window.open(this.href,'win2','".$status."'); return false;";
Con questa:
//$attribs['onclick'] = "window.open(this.href,'win2','".$status."'); return false;";
$attribs['target'] = "_blank";