Il back-end del sito è quella sezione a cui tu accedi mettendo nome utente e password lato amministrazione, in pratica il back-end è l'area di lavoro dell'amministratore.
p.s. se lavori su joomla 1.5 il percorso corretto è: menu estensioni - installa/disinstalla - selezioni il .zip del template e installi, poi vai da gestione template e scegli tu cosa fare, se renderlo predefinito, etc.