Perfetto, direi che la leggera differenza di mysql non può essere la causa.
Guardando la pagina di login del tuo pannello di amministrazione ho però notato, nel codice, che manca questa stringa (che ho preso dal codice di installazione base di Joomla, quindi strano che non ci sia): <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8" />
appena dopo <head>.
In effetti questo potrebbe essere la causa, purtroppo non avendo possibilità di fare il login non ho visione degli altri file, ma qui non c'è il charset ed il tuo problema è proprio di decodifica dei caratteri.
