se per carichi il sito intendi che lo trasferisci su serve linux, si. Anche se dovrebbe fare tutto il tuo host. Come è stato detto prima il backup è solo per sicurezza. Comunque quando hai in locale le cartelle e i file del sito e il database, al limite seguendo la guida di prima dovresti essere in grado di fare tutto, compreso importare il db sul server. Più semplice a farsi che a dirsi.