Ciao nicode88 e benvenuto nel forum jommla.it

Puoi rendere accessibile il tuo sito senza inserire /joo nel percorso url spostando, con un client ftp (consigliato filezilla), tutti i file e cartelle che adesso hai nella cartella joo, al suo livello superiore cioè nella root del sito che generalmene è htdocs.
Per esempio con filezilla tu vedrai i tuoi file in un percorso (simile)
/htdocs/joo/administrator
/htdocs/joo/components
ecc.
dopo lo spostamento li dovrai vedere così
/htdocs/administrator
/htdocs/components
ecc.
Fatto questo aggiusti il file configuration.php togliendo da tutti i percorsi la cartella joo.
Non toccare il database ed i suoi riferimenti
Buona permanenza