Ciao claudio.bonora e benvenuto sul forum joomla.it
Una volta capito il meccanismo, leggendo le guide di riferimento, ogni procedura di esportazione da remoto a remoto, da locale a remoto e viceversa è simile, in sintesi basta trasferire la cartella dei file del sito ed il suo database, ed aggiornare i riferimenti nel file configuration.php, per cui non ha importanza se sei in un dominio di secondo o terzo livello (domain.com --sub.domain.com) prima o dopo il trasferimento, è sufficiente inserire il percorso giusto nel suddetto file alla fine. Iinvece per i percorsi ai contenuti del sito se hai usato percorsi relativi (consigliabile) non hai problemi, se invece sono assoluti devi cambiarli a mano.