No peppeirace, il funzionamento è corretto. Resti solo disorientato per gli aspetti diversi del layout dei risultati della ricerca, una volta cliccati.
Osserva il pathway: joomla trova articoli non linkati da alcuna voce di menu e quindi pubblica questi in home-page. Ma se trova contenuti legati a una voce di menu mostra il layout di quella voce di menu.
Mi sembra che funzioni a dovere.
E non ti preoccupare troppo di queste piccole difformità di visualizzazione che avvengono con la ricerca.

Complimenti per l'ottima personalizzazione del beez

Il template si tradisce solo per il background dei risultati della ricerca...

Consiglio: io farei uno sfondo grigetto cambiano i colori qui:
ol.list li {
background:none repeat scroll 0 0 #FBF7FA;
border-bottom:1px solid #EFDEEA;
margin:10px 0;
padding:10px;
}
