La vuoi veloce o sicura l'alternativa?
Se la vuoi veloce continua ad usare il metodo da te usato.
Se la vuoi sicura fai tutto a manina, salvataggio-export db, copia in locale di file e cartelle.
p.s. parli di joomlapack, adesso da diverso tempo quello è akeeba, non è che stai usando un qualcosa di vecchiotto? Nel caso aggiorna.