Ciao
Come dice mau il nome a dominio non c'entra con la gestione del cms, il nome del dominio rappresenta l'indirizzo ove si trova il sito, qualsiasi indirizzo è indipendente da quello che ci metti dentro, CMS, sito html, applicazione java, ecc. vai pure tranquillo devi solo registrare il nuovo nome ed eventualmente trasferire i file e database di joomla, se su spazio diverso, altrimenti devi solo editare il file configuration.php aggiornando i percorsi delle variabili al nuovo nome dominio completo delle estensioni.