Ciao,
se ho capito cosa intendi, devi modificare il file "tdefault.css" del tuo template.
prova a variare i valori di margin e height di "#wrapper-top".
Atetnzione però: quel particolare div contiene una posizione per i moduli, togliendo il div o dandogli altezza 0 rischi di non vedere dei moduli eventualmente presenti in quella posizione..