Oddio quanto ci metti? Joomla ha poco più di 30 tabelle, se anche hai istallato tutto il mondo a quanto arrivi 300 tabelle?
Diciamo che rinomini 10 tabelle al minuto, 100 tabelle 10 minuti... non puoi metterci più di un'ora!!
Se rinomini tutte le bak_ in jos_ e il tuo vecchio sito aveva come prefisso jos_ dovrebbe tornare tutto ok, per sicurezza comunque fai il backup prima di iniziare!!!