come dice il ns David devi essere più preciso,
Così su due piedi ti direi che visto che hai i permessi di scrittura solo su una cartella...installa joomla su quella cartella affinche il suo contenuto sia tutto scrivibile

, ma poi si entra in un'altro discorso, quello di :
1)se sei un Professionista devi lavorare pulito ed evitare simili schifezze
2)potresti avere groooooooooooooooosssi problemi di sicurezza
3)controlla bene in quale posizione della root del tuo host sei
4) una soluzione c'è sempre...basta cercare e documentarsi!!
Aciao