confermo che nel template che hai usato non sono "utilizzati" i menu di secondo livello.
Nel codice html generato ci sono, ma la loro formattazinoe css ( la classe ".nav li ul" ) li posiziona in modo tale da non renderli visibili nella pagina.
alcune istruzioni in questa direzione sono: "visibility: hidden;", "width: 0;" e "left: -999em;".
chiaramente non basta commentarli..