dentro quelle cartelle ci sono già i file backuppati. Quando ne hai bisogno li copi da li e li incolli nella cartella in cui sono necessari. Ricorda che quelli sono sono una parte del materiale di joomla: l'altra metà è nel database e molto spesso ti conviene fare un backup anche su quello!
Sono contento che tu sia riuscito a risolvere, nel frattempo ti prego di aggiungere [risolto] al titolo del primo post!