Ciao.
Perfettamente inutile fare il lavoro due volte: se hai già una installazione che gira sul computer puoi trasferire quella, con un paio di attenzioni:
- Non trasferire il file configuration.php così come è, fanne una copia, correggilo inserendo i dati dell'host al posto di quelli tuoi locali, poi trasferisci il file corretto;
- Svuota le cartelle logs e tmp, lasciaci solo i files php e index.html;
- Prima di fare il trasferimento chiudi il front-end, cancella da back-end la cache sia del sito sia dell'admin e cancella la cache obsoleta, poi chiudi anche il back-end.
Il trasferimento fallo con il programma FTP che ti pare, vanno bene tutti.