Hai il sito bucato.
Se hai la possibilità di fare una nuova installazione con le estensioni che utilizzi ed un nuovo database falla, poi quando hai portato il sito con le stesse funzionalita seo del tuo, edita il file configuration.php e modifichi i parametri relativi al database, quelli del nome,passwor e nome database, inserendogni le vecchie credenziali.
Attenzione al tuo template perchè se lo inserisci senza pulirlo il sito non funzionerà.
Sicuramente non avevi una versione aggiornata di joomla ed è per questo chè è stato possibile bucare il sito anche se non ha senso rompere le scatole a siti tipo il tuo.......
Se re-installi come ti ho indicato devi farlo con la versione di joomla 1.5.25 che puoi trovare nella sezione download.
Questo metodo ti consente di non doverti spluciare migliaia di file per ripulirli da codice malevolo, re-istallando da capo non devi pulire niente e ricollegando il vecchio database ritrovi tutti i vecchi articoli, però potresti avere qualche difficoltà se hai delle gallerie.