ho qualche dubbio che se veramente va fatta quella procedura, forse c'è qualcosa che non va nell'installazione. Nelle guide ufficiali non si parla di eliminare questi file.......
Uno dei problemi più comuni che genera cattive installazioni e problemi vari è il non perfetto trasferimento dei file dal tuo pc al server, di solito si dimentica di guardare se ci sono file non trasferiti o trasferiti con errore, inoltre utilizzando certi client ftp gli errori sono quasi certi.
Consiglio a tutti di utilizzare client ftp come filezilla, dove a colpo d'occhio visualizzi se qualche file non è stato trasferito ed è ancora in coda oppure non è stato trasferito semplicemente.
Filezilla è multipiattaforma, quindi esiste per win, mac e linux