Ho installato un altro programma FTP, ed è tutto ok!
Girando per il web ho scoperto che l'aggiornamento alla versione di FileZilla 3.5.3 può dare qualche problema.
Quindi:
1) Killate le connessioni FTP in corso sulla macchina dal pannello del vostro hosting;
2) Oppure provate ad installare un altro programma FTP (fate la prova se l'errore lo avete comunque su server diversi, per chi ne avesse più di uno diverso).