mmm le cause che portano a questo problema possono essere tante,
hai installato qualche componente o modulo e lo fai caricare nella home? in caso quale?
non avendo fatto una migrazione da una versione precedente di Joomla escluderei un problema con gli alias!
se mi dai il link posso provare a dare un'occhiata!
altre info:
1)in locale te l'ha mai fatto?
2)quando lavoravi in locale, digitavi l'ip del server, o lavoravi comunque con il DNS del tuo dominio? (in caso utilizzavi qualche sottodominio che potrebbe aver dato fastidio alla configurazione di joomal dopo il trasferimento)