"A volte è meglio tacere e passare per stolti, che parlare e dissipare ogni dubbio." questa è la frase originale.
Comunque sia stai facendo una cosa stupida. Non ha alcun senso rimuovere il criptaggio delle password di Joomla.
Invece dovresti aggiungere un criptaggio al software che vuoi collegare.
In questo modo entrambi i software utilizzerebbero un database di password criptate alla stessa maniera.
Quando un utente prova ad accedere, inserisce la password, essa viene criptata, Joomla o l'altro software (dipende da dove sta effettuando il login) controllano che la password inserita dall'utente corrisponda a quella salvata nel database, e in caso positivo lo autentica.
Tu invece vorresti fare esattamente il processo inverso, e non ha senso oltre ad essere molto vulnerabile.
È logico che la gente cerchi di scoraggiarti per evitare di farti fare un'assurdità del genere.
Intanto dicci che diamine di software devi bridgiare con Joomla almeno vediamo se esiste un bridge già fatto.