Non so se è stato causato da me con la piccole modifiche dei css che ho fatto.
Sì, almeno credo. In position.css c'è una proprietà per leftbigger con width 25% che secondo me hai aggiunto tu e sovrascrive la width 21% di .left1
In questo modo hai superato lo spazio disponibile nella pagina e IE manda a capo il contenuto.
Se vuoi mantenere la colonna di sinistra al 25% riduci wrapper2 al 68%
Inoltre sul mio schermo che è un 1280x1024 hai una barra di scorrimento orizzontale che è determinata dall'immagine fruits.jpg che mi risulta essere vuota ma lunga 1280px
La trovi in nel div header-image