1) Nel caso non volessi disinstallarlo non dovresti andare incontro a problemi. Pero non puoi aggiornare joomla, CB e altri componenti se non hai le patch di aggiornamento fornite dal produttore di jacl. Jacl, infatti, più che un componente, è da considerarsi una hack di joomla. Quindi svariati files, oltre alla struttura del DB, vengono modificati. Se aggiornassi uno dei file modificati con un pacchetto "originale", potresti arrivare a non poterti loggare nel sistema.
2) Nel caso di disinstallazione, sono frequenti i problemi di accesso. Se dai una occhiata al sito del produttore e al forum ti renderai conto da solo.
considera che la versione a pagamento di jacl cripta alcuni core-files per evitare che vengano modificati "improvvidamente", fermo restando che i produttori sono disponibili a modificarli per te. Quindi tu invii loro i files criptati, questi vengono modificati e reinviati (sempre criptati) per sostituire quelli già esistenti
Questo l'indirizzo del produttore di jacl
http://www.byostech.com/