Per chiudere questa discussione che ho aperto qualche tempo fa riporto gli ultimi sviluppi se possono interessare.
Nel caso dell'iscrizione al dominio .gov.it la soluzione migliore è quella di realizzare un nuovo sito sotto il dominio .gov.it e per mantenere attivo il vecchio dominio .it con un redirect tra .it e .gov.it
Nel mio caso, non essendoci le condizioni per sviluppare un nuovo sito, ho iscritto il sito esistente a digitpa per avere il dominio .gov.it e poi tramite un secondo provvider ho realizzato un redirect tra .gov.it e il sito esistente .it
La soluzione non è il massimo perchè utilizza un iframe ma per il momento va bene così.