per questa domanda ci sono migliaia di guide sui permessi e sugli accessi.
Quindi un bel "CERCA" era sufficiente.
Al di la di questo è molto semplice, ogni volta che crei una voce di menu piuttosto che una categoria o un articolo ecc puoi impostare alla voce ACCESS una tra le tre opzioni di default che sono public, registred e special.
Per modificare o ampliare queste tre voci devi andare alla sezione Utenti e poi livelli di accesso se vuoi modificare le tre categorie citate sopra, se invece ne vuoi creare di nuove sempre nel menu Utenti devi andare su Gruppi.
Spero sia tutto chiaro.
Inoltre esistono componenti che ti permettono di gestire i download, devi cercare nella JED.