Ma, anche quando (filezilla ti consentirebbe di aprire il file mentre sta sul server) l'ftp utilizza l'editor che tu imposti come predefinito per l'apertura dei file con estensione php.
Che ti cambia?
Il file lo hai sul pc? aprilo, cambi e uppi.
In ogni caso, se htaccess non è ancora .htaccess, ma ancora è htaccess.txt, lo puoi aprire e modificare con joomlaxplorer