Ciao Six73, ritengo la tua domanda è interessante.
Ho sempre pensato che utilizzare i metatag in entrambe le posizione fosse la scelta migliore, in quanto credo che i motori di ricerca mappino lo stesso contenuto con due indirizzi differenti in funzione di come vengono indirizzati.
Per esempio sicuramente dal menu in quanto c'è la voce nella tua sitemap, ma anche nell'articolo recuperato tramite una ricerca, o indirizzato direttamente, che hanno una URL differente.
Probabilmente riuscire ad avere sufficiente fantasia per esprimere due descrizioni e due elenchi di parole meta differente sarebbe la soluzione migliore.
Attendo volentieri con curiosità la risposta di qualcuno più esperto!
Ciao e grazie