NI, secondo me a questo punto, per come è messo joomla 3.1.5 e per l'abbondanza di estensioni o almeno le più utilizzate, conviene che tu inizi con la nuova versione, alla versione 3.5 che è il ramo stabile, la 3.1.5 ci si avvicina moltissimo.
per scegliere comunque quale utilizzare per un sito, basati sulle estensioni disponibili: ad esempio per adesso in alcuni casi non ho potuto realizzare il sito nella 3.1.5 perchè avevo bisogno di utilizzare JoomD un componente che per adesso c'è solo per la 2.5.